Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HDAC1Q13547 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
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