Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CHAF1AQ13111 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
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