Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
CSTF3Q12996 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CSTF3Q12996 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms