Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
FOXC1Q12948 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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FOXC1Q12948 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
FOXC1Q12948 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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