Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
SCAPQ12770 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SCAPQ12770 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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