Protein–RNA interactions for Protein: Q08E93

FAM27E3, Protein FAM27E3, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM27E3Q08E93 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
FAM27E3Q08E93 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
FAM27E3Q08E93 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms