Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE4CQ08493 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE4CQ08493 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms