Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDE4BQ07343 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDE4BQ07343 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms