Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EXOSC9Q06265 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EXOSC9Q06265 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms