Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
CD164Q04900 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
CD164Q04900 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
CD164Q04900 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms