Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
GBE1Q04446 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms