Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PLOD1Q02809 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms