Protein–RNA interactions for Protein: Q00978

IRF9, Interferon regulatory factor 9, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF9Q00978 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IRF9Q00978 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms