Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 OCEL1-201ENST00000215061 1133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CACNA1BQ00975 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms