Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
FAM3AP98173 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM3AP98173 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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FAM3AP98173 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
FAM3AP98173 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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