Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IRX1P78414 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IRX1P78414 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms