Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
HERVK_113P63132 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms