Protein–RNA interactions for Protein: P59044

NLRP6, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP6P59044 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
NLRP6P59044 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms