Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CLDN2P57739 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CLDN2P57739 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.3 ms