Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SNU13P55769 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SNU13P55769 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNU13P55769 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms