Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
CACNB3P54284 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CACNB3P54284 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms