Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COPAP53621 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COPAP53621 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COPAP53621 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms