Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ERFP50548 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ERFP50548 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ERFP50548 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERFP50548 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERFP50548 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
ERFP50548 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
ERFP50548 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms