Protein–RNA interactions for Protein: P49798

RGS4, Regulator of G-protein signaling 4, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGS4P49798 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RGS4P49798 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RGS4P49798 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RGS4P49798 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms