Protein–RNA interactions for Protein: P49756

RBM25, RNA-binding protein 25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM25P49756 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM25P49756 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM25P49756 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM25P49756 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM25P49756 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RBM25P49756 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBM25P49756 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
RBM25P49756 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RBM25P49756 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RBM25P49756 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RBM25P49756 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM25P49756 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM25P49756 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM25P49756 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RBM25P49756 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms