Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSFMP43897 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSFMP43897 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
TSFMP43897 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
TSFMP43897 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TSFMP43897 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TSFMP43897 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TSFMP43897 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TSFMP43897 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms