Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
COPB2P35606 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
COPB2P35606 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
COPB2P35606 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
COPB2P35606 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms