Protein–RNA interactions for Protein: P35499

SCN4A, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN4AP35499 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SCN4AP35499 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
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