Protein–RNA interactions for Protein: P35243

RCVRN, Recoverin, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCVRNP35243 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
RCVRNP35243 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RCVRNP35243 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms