Protein–RNA interactions for Protein: P33992

MCM5, DNA replication licensing factor MCM5, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM5P33992 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
MCM5P33992 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MCM5P33992 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MCM5P33992 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MCM5P33992 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MCM5P33992 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms