Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
OTX2P32243 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
OTX2P32243 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OTX2P32243 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
OTX2P32243 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
OTX2P32243 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
OTX2P32243 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms