Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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CASQ1P31415 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
CASQ1P31415 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CASQ1P31415 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
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