Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GTF2E1P29083 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GTF2E1P29083 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms