Protein–RNA interactions for Protein: P28838

LAP3, Cytosol aminopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAP3P28838 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
LAP3P28838 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAP3P28838 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAP3P28838 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
LAP3P28838 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
LAP3P28838 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms