Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
GCAP28676 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
GCAP28676 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
GCAP28676 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
GCAP28676 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
GCAP28676 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms