Protein–RNA interactions for Protein: P28288

ABCD3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD3P28288 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ABCD3P28288 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ABCD3P28288 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms