Protein–RNA interactions for Protein: P26842

CD27, CD27 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27P26842 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CD27P26842 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CD27P26842 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CD27P26842 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD27P26842 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CD27P26842 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CD27P26842 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms