Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PTX3P26022 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PTX3P26022 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms