Protein–RNA interactions for Protein: P25490

YY1, Transcriptional repressor protein YY1, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YY1P25490 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
YY1P25490 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YY1P25490 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YY1P25490 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YY1P25490 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YY1P25490 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YY1P25490 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YY1P25490 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
YY1P25490 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YY1P25490 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms