Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CD247P20963 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CD247P20963 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CD247P20963 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
CD247P20963 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms