Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
C4BPBP20851 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
C4BPBP20851 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms