Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CCNA2P20248 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 430.7 ms