Protein–RNA interactions for Protein: P17947

SPI1, Transcription factor PU.1, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPI1P17947 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
SPI1P17947 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
SPI1P17947 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SPI1P17947 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms