Protein–RNA interactions for Protein: P17029

ZKSCAN1, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN1P17029 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZKSCAN1P17029 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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