Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ATP2A2P16615 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP2A2P16615 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms