Protein–RNA interactions for Protein: P15941

MUC1, Mucin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1P15941 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
MUC1P15941 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
MUC1P15941 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
MUC1P15941 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms