Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
GP1BBP13224 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms