Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LYL1P12980 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms