Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
VPREB1P12018 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms