Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ESRRAP11474 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ESRRAP11474 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms